Перед началом сезона семейчане рассчитывали побороться за медали. Команда сохранила костяк, главного тренера Андрея Карповича и усилилась несколькими футболистами. Кроме того, бюджет клуба составил 2,808 млрд тенге — один из крупнейших в стране.
Старт КПЛ получился неплохим: в первых семи турах «Елимай» не проигрывал, обыграл «Тобол» и «Актобе», а также сыграл вничью с «Астаной» и «Кайратом». Но затем команда столкнулась с кризисом. Особенно заметными оказались проблемы в обороне: за 30 матчей чемпионата семейчане забили 43 гола, но пропустили 44.
Главным разочарованием стало выступление в Лиге конференций. В первом квалификационном раунде «Елимай» встретился с армянским «Алашкертом». После ничьей 1:1 в гостях казахстанский клуб считался фаворитом ответной встречи в Семее. Однако матч завершился со счётом 1:1 в основное время и перешёл в дополнительное. На 96-й минуте Хрвое Илич реализовал пенальти, но на 121-й минуте «Елимай» пропустил автогол. В серии пенальти семейчане уступили со счётом 5:6 и завершили еврокубковый путь уже на старте.
В Кубке Казахстана команда также не добилась успеха, вылетев в 1/8 финала после поражения от «Актобе» (1:2). В чемпионате семейчане часто теряли очки в матчах с командами из нижней части таблицы и в итоге заняли шестое место.
По ходу сезона команду покинул Андрей Карпович, который руководил клубом три года, но так и не смог привести его к медалям или трофеям. Заключительный матч чемпионата «Елимай» провёл под руководством Серикбека Каппарова.
Итог сезона оказался худшим для клуба с момента возвращения в КПЛ в 2024 году по среднему количеству набранных очков за матч. Теперь семейчанам предстоит найти нового сильного тренера, усилить состав и сохранить ведущих казахстанских футболистов.